L’albero più antico qui situato – la duecentesca Quercia Jagellonica (Dąb Jagielloński) – ha probabilmente la stessa età del giardino. Il giardino botanico più antico della Polonia tuttora esistente fu fondato nel 1783 proprio a Cracovia.

La struttura conobbe un rapido sviluppo: a meno di un ventennio dalla fondazione conteneva già circa 3000 piante. Oltre alle specie locali e curative venivano coltivate anche piante esotiche. I visitatori potevano acquistare (o ricevevano in dono) ananas, meloni, cocomeri, arance, uva... Quando in una serra l’albero di banane diede i primi frutti (1791) il fiero direttore ne inviò alcuni esemplari a Varsavia per farli assaggiare al re Stanislao II Augusto Poniatowski. Il sovrano, in segno di gratitudine per il dono ricevuto, e per la gioia del direttore, destinò all’istituzione un’ingente somma. Qualcuno osava forse sognare, allora, che sarebbero giunti tempi in cui le banane sarebbero state reperibili in qualsiasi negozio?